Une méthode pour pouvoir travailler sur les combinaisons de variants génétiques propres à un trait de caractère
L’étude des variants génétiques permettant d’expliquer des traits de caractères spécifiques se faisait à ce jour variant par variant. Or c’est souvent leurs combinaisons qui a de l’intérêt. Dans un article publié dans la revue Genome Biology, les scientifiques décrivent une méthode mêlant mathématique, génétique et calcul haute performance pour créer des cartes d’interactions exhaustives rassemblant plusieurs dizaines de milliards d’interaction entre variants génétiques et permettant d’étudier ces combinaisons.
Référence
Carré, C., Carluer, J.B., Chaux, C. et al. Next-Gen GWAS: full 2D epistatic interaction maps retrieve part of missing heritability and improve phenotypic prediction. Genome Biol 25, 76 (2024). https://doi.org/10.1186/s13059-024-03202-0.