Modélisation de la propagation des variants en France : de l’émergence au remplacement
Les variants du SARS-CoV-2 ont radicalement changé la donne de l’épidémie de COVID-19, conduisant par exemple à un 3e confinement national. Une collaboration née à l’automne 2020 entre l’équipe de modélisation « Évolution Théorique et Expérimentale » du laboratoire Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), le CHU de Montpellier et le laboratoire CERBA a rapidement permis de quantifier l’avantage de transmission des variants et de suivre leur propagation. Une partie de ces travaux a été publiée dans les revues Emerging Infectious Diseases et Eurosurveillance.
Grâce à une collaboration et une étude clinique mise en place dès la fin 2020 entre l’équipe de modélisation ETE du laboratoire Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC – CNRS / IRD / Université de Montpellier), le CHU de Montpellier et le laboratoire CERBA, les chercheurs ont pu analyser les résultats des tests de criblage en France et partager dès le 23 février 2021 la première estimation de l’avantage de transmission des variants en France par rapport aux souches ancestrales.
Références
Haim-Boukobza S, Roquebert B, Trombert-Paolantoni S, Lecorche E, Verdurme L, Foulongne V, Selinger C, Michalakis Y, Sofonea MT, Alizon S. 2021. Detecting rapid spread of SARS-CoV-2 Variants, France, January 26–February 16, 2021. Emerging Infectious Diseases 27:1496–1499.
Roquebert B, Trombert-Paolantoni S, Haim-Boukobza S, Lecorche E, Verdurme L, Foulongne V, Sofonea MT, Alizon S. 2021. The SARS-CoV-2 B.1.351/V2 variant is outgrowing the B.1.1.7/V1 variant in French regions in April 2021. Eurosurveillance, in press