Comment les génomes viraux alertent sur l’épidémie de l’hépatite C à Lyon
Le séquençage des génomes viraux et les outils de la phylodynamique peuvent aider la santé publique. Une équipe de recherche a permis de quantifier la propagation du virus de l’hépatite C dans la région lyonnaise. Ces travaux sont publiés dans la revue PloS Pathogens.
Analyser les séquences génétiques des lignées de virus permet de mieux connaître "l'histoire" de ces infections et leurs corrélations. Dans ces travaux soutenus par la fondation pour la recherche médicale (FRM), les scientifiques de MIVEGEC et leurs partenaires hospitaliers lyonnais ont pu distinguer deux épidémies distinctes de l'hépatite C dans la population lyonnaise et ainsi proposer un outil de prévention et de prise en charge plus fine.
Référence
Gonché Danesh, Victor Virlogeux, Christophe Ramière, Caroline Charre, Laurent Cotte, Samuel Alizon (2021) Quantifying transmission dynamics of acute hepatitis C virus infections in a heterogeneous population using sequence data. PLoS Pathogens, in press